Buku ini mengambil tema penting, yakni tentang penanaman nilai-nilai toleransi pada lembaga pendidikan Islam seperti pondok pesantren. Dalam kaitan ini, pesantren yang disorot adalah pesantren yang tergolong tua usianya, yaitu Pesantren Sumatera Thawalib Parabek Bukit Tinggi, Pesantren An-Nuqayah Guluk-Guluk Madura, Pesantren Al-Amin Prenduan Madura, dan Pesantren Lirboyo Kediri. Toleransi merupakan suatu bentuk kesadaran yang teramat penting dan sangat dibutuhkan oleh semua orang untuk memastikan kelangsungan hidup mereka berlangsung dengan baik. Konflik dan disintegrasi dalam masyarakat yang dipicu oleh banyak faktor, baik agama, politik, dan ekonomi sering dipicu oleh ketiadaan kesadaran bertoleransi dalam masyarakat. Buku ini mencoba menggali nilai-nilai toleransi yang telah lama terinternalisasi pada lembaga pendidikan Islam yang tersebar di tanah air. (Islamic Boarding Schools/ Islamic Theology)